Badanie mechanizmu działania glikozydów całkowitych Cistanche na chorobę zapalną jelit w oparciu o farmakologię sieciową i eksperymenty na zwierzętach Ⅲ

3 Wyniki i analiza

3.1 Analiza docelowych docelowych ilości glikozydów całkowitych Cistanche tubulosa i celów chorobowych

Zaimportuj pliki struktury trójwymiarowejSkładniki aktywnedo bazy danych PharmMapper, aby uzyskać odpowiednie punkty docelowe odpowiadające różnym składnikom. Bazę danych UniProt wykorzystano do uzyskania informacji o nazwie białka i nazwie genu odpowiadającej każdemu celowi. Łącząc punkty docelowe odpowiadające siedmiu komponentom, uzyskano w sumie 354 cele. W bazie danych GeneCards przeszukano odpowiednie geny przy użyciu słowa kluczowego „nieswoiste zapalenie jelit”, a wyniki wyszukiwania posortowano i ostatecznie uzyskano 7851 celów. Użyj zdarzeń, aby narysować diagram Venna online, aby uzyskać przecięcie docelowych składników aktywnych Cistanche tubulosa i punktów docelowych IBD. Jak pokazano na Figurze 1, 254 cele aktywnego składnikaCistanche tubulosaktóre mają działanie ochronne w przypadku IBD.

Ryc.2 Schemat sieci PPI wspólnych celów

Ryc. 5 Sieć komponent-cel-ścieżka

Ryc. 7 Całkowite glikozydy Cistanche tubulosa regulują w dół mRNA szlaków sygnałowych TGF i mTOR u myszy z IBD

3.4 Glikozydy całkowite Cistanche tubulosa poprawiają wynik DAI indukowany DSS

Wyniki testu wykazały, że z wyjątkiem grupy CZ, pozostałe trzy grupy charakteryzowały się różnym stopniem utraty masy ciała i występowaniem krwi utajonej w kale (ryc. 6). Wśród nich grupa kontrolna DSS charakteryzowała się najwyższym współczynnikiem utraty masy ciała, najcięższą krwią w kale, najwyższym DAI i oczywistym krwawieniem z kału w 6 dniu. Po interwencji glikozydów całkowitych Cistanche tubulosa, wynik DAI stopniowo się zmniejszał, a poziom krwi utajonej stopniowo się zmniejszał. Grupa HZ charakteryzowała się najniższym współczynnikiem utraty masy ciała i najmniejszą ilością krwi ukrytej w kale. Wyniki wykazały, że całkowite glikozydy Cistanche tubulosa poprawiają reakcje fizjologiczne spowodowane chorobą zapalną jelit.

SUPLEMENT CISTANCHE DO LECZENIA IBD PHGS75% ECH 30% ACT 12%

3.5 Glikozydy całkowite Cistanche tubulosa zmniejszają IBD

Ekspresja szlaków sygnalizacyjnych mTOR i TGF w śledzionie myszy Szlaki sygnalizacyjne mTOR i TGF to dwa ważne szlaki sygnalizacyjne, które aktywują odpowiedź zapalną. Ekspresję mTOR i TGF- w tkance śledziony myszy wykrywano metodą qRT-PCR. Wyniki pokazały, że ekspresja mRNA mTOR i TGF- u myszy z grupy kontrolnej DSS była znacząco zwiększona w porównaniu z ekspresją u normalnych myszy. W porównaniu z myszami kontrolnymi DSS. W porównaniu z Cistanche tubulosa, ekspresja mTOR i TGF- u myszy była znacząco zmniejszona po interwencji Cistanche tubulosa. Wśród nich grupa otrzymująca dużą dawkę odnotowała najbardziej znaczący spadek, a poziom ekspresji był w zasadzie zgodny z poziomem w grupie normalnej (Rysunek 7). Wyniki wykazały, że glikozydy całkowite Cistanche tubulosa zmniejszają ekspresję szlaków sygnalizacyjnych mTOR i TGF.

Ryc. 8 Mapa cieplna klastrów2-funkcjonalnej liczebności PICRUSt

3.6 Analiza adnotacji funkcjonalnych PICRUSt2

PICRUSt2 to narzędzie bioinformatyczne służące do przewidywania funkcji metagenomicznych w oparciu o informacje o biologicznym 16S rRNA, drzewie ASV i genach ASV w bazie danych Greengene. Do przewidywania funkcjonalnego wykorzystano wybraną bazę danych COG, a wyniki wykazały, że funkcje flory jelitowej obejmują głównie przetwarzanie RNA; struktura i dynamika chromatyny; kontrola cyklu komórkowego, podział komórkowy, segmentacja chromosomów; mechanizm obronny; sygnalizacja biogenezy ściany komórkowej/błony komórkowej/otoczki; komórki Ma ponad 20 funkcji, takich jak struktura zewnątrzkomórkowa; transport wewnątrzkomórkowy, wydzielanie i transport pęcherzykowy; produkcja i konwersja energii; transport i metabolizm węglowodanów. Wybierz 15 najliczniejszych cech i informacje o ich liczebności w każdej próbceDla celów informacyjnych sporządzana jest mapa cieplna (rysunek 8), połączona z różnymi poziomami funkcjonalnymi.

W porównaniu z grupą CZ, myszy z grupy kontrolnej DZ miały COG1132 (system transportu wielu leków typu ABC), COG0745 (regulator odpowiedzi na wiązanie DNA), COG1131 (system transportu wielu leków typu ABC), COG1961 (specyficzna dla miejsca rekombinaza DNA związana z Pin inwertazy DNA), COG0438 (zaangażowana glikozylotransferazaw biosyntezie ściany komórkowej), COG0534 (napędzany Na +-wielolekowa pompa wypływowa), COG0642 (kinaza histydynowa przekazująca sygnał), COG1595 (podjednostka sigma wyspecjalizowana polimerazy RNA kierowanej przez DNA), COG0463 (endonukleaza), COG4974 (rekombinaza specyficzna dla miejsca XerD), COG2207 (domena wiążąca DNA typu AraC i AraC - zawierający białka), COG1136 (system eksportu lipoprotein typu ABC) i COG1309 (regulator transkrypcji wiążący DNA) funkcjonalne nieprawidłowości w ekspresji genów. Geny te są głównie zaangażowane w: V: mechanizm obronny; T: mechanizm przekazywania sygnału; M: biogeneza ściany komórkowej/błony komórkowej/otoczki; I: transport i metabolizm lipidów; K: transkrypcja; L: replikacja, rekombinacja i naprawa.

Po podaniu tym sześciu funkcjom całkowitych glikozydów Cistanche tubulosa, ekspresja tych różnych funkcji fizjologicznych była zbliżona do tej występującej w grupie normalnej. W porównaniu z myszami w grupach CZ i DZ, myszy w grupie HZ wykazywały wysoką ekspresję genów COG1028 (rodzina krótkołańcuchowych dehydrogenaz alkoholowych) i COG0451 (epimeraza nukleozydowo-fosforanowo-cukrowa). Te dwa geny są powiązane z I: transportem lipidów i metabolizmem. Oraz M: Funkcje biogenezy ściany komórkowej/błony komórkowej/otoczki są ze sobą ściśle powiązane. Dlatego spekuluje się, że glikozydy całkowite Cistanche tubulosa mogą regulować uszkodzenia myszy z IBD poprzez regulację metabolizmu lipidów, metabolizmu glukozy i powiązanych mechanizmów przekazywania sygnałów obronnych u myszy.