Pojedyncza komórka i odporność: lepsze zrozumienie heterogeniczności komórek odpornościowych dzięki sekwencjonowaniu pojedynczych komórek
Dec 15, 2023
Delikatna równowaga odporności wynika z częstych przesłuchów i skomplikowanych interakcji pomiędzy różnymi typami komórek. Komórki odpornościowe są bardzo zróżnicowane pod względem typów komórek i statusu aktywacji. Metody sekwencjonowania tkanek i komórek masowych wychwytują ogólne sygnatury z próbek mieszanych, z subtelnymi sygnaturami genów z rzadkich, ale funkcjonalnie ważnych typów komórek objętych licznymi populacjami komórek.

cistanche tubulosa – poprawiają układ odpornościowy
Co więcej, komunikację wewnątrz- i międzykomórkową niosącą istotne wskazówki dotyczące proliferacji, różnicowania, dojrzewania, migracji i przejścia komórek odpornościowych trudno jest scharakteryzować przy użyciu tradycyjnych metod. Bieżące wydanie specjalne miało na celu skupienie się na szybkim postępie badań jednokomórkowych nad odpornością zakaźną, immunologią nowotworów, odpornością wrodzoną i zaburzeniami układu odpornościowego, jak pokazano na rycinie 1.

Cistanche korzyści dla mężczyzn-wzmocnienie układu odpornościowego
Sekwencjonowanie pojedynczych komórek ma wpływ naukowy na odkrycia kliniczne i translacyjne. W ostatniej dekadzie sekwencjonowanie RNA pojedynczych komórek (scRNA-seq) zapoczątkowało prawdziwą rewolucję w badaniach immunologicznych. Jako narzędzia do profilowania molekularnego pojedynczych komórek, technologie scRNA-seq zapewniają lepsze zrozumienie heterogeniczności związanej z poszczególnymi komórkami odpornościowymi oraz odpowiedzi na poziomie molekularnym w warunkach fizjologicznych i patologicznych.1 W badaniach opartych na sekwencjonowaniu pojedynczych komórek z powodzeniem zidentyfikowano nowe podzbiory komórek odpornościowych i trajektorie rozwojowe.2 Choroby zakaźne i nowotwory stanowią pilne zagrożenie dla zdrowia ludzkiego. Dużym wyzwaniem pozostaje to, jak przełożyć naszą wiedzę na temat molekularnego mechanizmu regulacji układu odpornościowego na terapie kliniczne.

Cistanche roślina zwiększająca układ odpornościowy
Kliknij tutaj, aby wyświetlić produkty Cistanche Enhance Immunity
【Zapytaj o więcej】 E-mail:cindy.xue@wecistanche.com / Aplikacja Whats: 0086 18599088692 / Wechat: 18599088692
Dzięki technologii scRNA-seq dokonano znaczących przełomów. Na przykład przy rozdzielczości pojedynczych komórek odkryto odrębne szlaki odpowiedzi immunologicznej między infekcjami wirusem grypy A a koronawirusem ciężkiego ostrego zespołu oddechowego-2 (SARS-CoV-2).3 SARS-CoV{{ 7}}przeciwciała neutralizujące zidentyfikowano przy użyciu sekwencji scRNA komórek B wzbogaconych w antygen pacjentów z COVID-19.4 Systematycznie konstruowano atlas odporności międzytkankowej i atlas odporności rozwojowej człowieka.5,6 Sekwencja scRNA Udowodniono, że technologia ta jest potężnym narzędziem do odkrywania mechanizmów ucieczki układu odpornościowego w tkankach nowotworowych.7

RYCINA 1 Tematyka pojedynczych komórek i odporności koncentruje się głównie na zaburzeniach układu odpornościowego, odporności zakaźnej, odporności na nowotwory, odporności zapalnej, odporności związanej z wirusami i odporności wrodzonej. Schematy schematyczne zostały utworzone za pomocą BioRender.com.

cistanche tubulosa – poprawiają układ odpornościowy
Istnieje szybki postęp w zakresie narzędzi analitycznych jednokomórkowych. Opracowano szeroką gamę kompleksowych internetowych baz danych do przechowywania i analizy jednokomórkowych zbiorów danych.8–13 Pilnie potrzebne jest wprowadzenie większej liczby innowacyjnych narzędzi bioinformatycznych do integracji danych pochodzących z różnych technologii i typów danych. Jednym z kluczowych zadań jest standaryzacja adnotacji komórek odpornościowych i wykorzystanie pełnego spektrum typów danych. Umożliwi to współpracę w zakresie analizy danych między środowiskiem akademickim, przemysłem i instytucjami klinicznymi. Zatem skoordynowane wysiłki podjęte w ramach tego specjalnego numeru tematycznego pogłębią naszą wiedzę na temat badań i terapii immunologicznych.

cistanche tubulosa – poprawiają układ odpornościowy
BIBLIOGRAFIA
1. Giladi A, Amit I. Genomika pojedynczych komórek: odskocznia do przyszłych odkryć immunologicznych. Komórka. 2018;172(1):14-21. https://doi.org/ 10.1016/j.cell.2017.11.011
2. Papalexi E, Satija R. Sekwencjonowanie RNA pojedynczych komórek w celu zbadania heterogeniczności komórek odpornościowych. Nat Rev Immunol. 2018;18(1):35-45. https://doi.org/10.1038/nri.2017.76
3. Zhu L, Yang P, Zhao Y i in. Sekwencjonowanie pojedynczych komórek obwodowych komórek jednojądrzastych ujawnia odrębne krajobrazy odpowiedzi immunologicznej u pacjentów z Covid-19 i grypą. Odporność. 2020;53(3):685- 696. https://doi.org/10.1016/j.immuni.2020.07.009. e3.
4. Cao Y, Su B, Guo X i in. Silne przeciwciała neutralizujące przeciwko SARS-CoV-2 zidentyfikowane poprzez wysokoprzepustowe sekwencjonowanie pojedynczych komórek komórek B rekonwalescencji pacjentów. Komórka. 2020;182(1):73-84. https://doi.org/10.1016/j.cell.2020.05.025. e16.
5. Suo C, Dann E, Goh I i in. Mapowanie rozwijającego się układu odpornościowego człowieka w różnych narządach. Nauka. 2022;376(6597):eabo0510. https://doi.org/10.1126/science.abo0510
6. Domínguez Conde C, Xu C, Jarvis LB i in. Analiza międzytkankowych komórek odpornościowych ujawnia cechy specyficzne dla tkanki u ludzi. Nauka. 2022;376(6594):eabl5197. https://doi.org/10.1126/science.abl5197
7. Zhang Y, Wang D, Peng M i in. Sekwencjonowanie RNA pojedynczych komórek w badaniach nad nowotworami. J Exp Clin Cancer Res. 2021;40(1):81. https://doi. org/10.1186/s13046-021-01874-1
8. Chen D, Tan C, Ding P i in. VThunter: baza danych do badań przesiewowych pojedynczych komórek docelowych komórek wirusów w królestwie zwierząt. Kwasy nukleinowe Res. 2022;50(D1):D934-D942. https://doi.org/10.1093/nar/gkab894
9. Chen Y, Zhang X, Peng X i in. SPEED: Atlas jednokomórkowy pan-gatunkowy w świetle ekologii i ewolucji rozwoju i chorób. Kwasy nukleinowe Res. https://doi.org/10.1093/nar/gkac930. Opublikowano w Internecie 28 października 2022 r.:gkac930.
10. Han X, Wang R, Zhou Y i in. Mapowanie atlasu komórek mysich za pomocą mikrostudzienek-Seq. Komórka. 2018;172(5):1091-1107. https://doi.org/10. 1016/j.komórka.2018.02.001. e17.
11. Chen D, Sun J, Zhu J i in. Atlas jednokomórkowy dla 11 niemodelowych ssaków, gadów i ptaków. Nat Commun. 2021;12(1):7083. https://doi.org/10.1038/s41467-021-27162-2
12. Han X, Zhou Z, Fei L i in. Budowa krajobrazu komórek ludzkich na poziomie pojedynczych komórek. Natura. 2020;581(7808):303-309. https://doi.org/10.1038/s41586-020-2157-4
13. Ma P, Liu X, Xu Z i in. Wspólne profilowanie ekspresji genów i dostępności chromatyny podczas rozwoju amfioksusa przy rozdzielczości pojedynczych komórek. Cell Rep. 2022;39(12). https://doi.org/10. 1016/j.celrep.2022.110979
